جامعه باکتری‌های خاک ریزوسفر متفاوت است و با کیفیت زعفران در چهار مکان همبستگی دارد

زعفران کلاله‌های خشک‌شده Crocus sativus (Iridaceae) است که محصولی معطر و آشپزی بسیار ارزشمند است. میکروبیوم‌های ریزوسفر عامل اصلی تأثیرگذار بر تولید و کیفیت متابولیت‌های ثانویه و روغن‌های اسانسی در گیاهان آشپزی، و زعفران است. ما فرض کردیم که رابطه بین میکروبیوم ریزوسفر و شاخص‌های کیفیت زعفران (کروسین، پیکروکروسین و سافرانال) از Crocus sativus در هر مکان در منطقه غایین (ایران) متفاوت است، با استفاده از رویکرد متابارکودینگ. با وجود شرایط آب و هوایی مشابه و شیوه‌های کشاورزی، کیفیت زعفران در یک مکان بالاتر از مکان‌های دیگر بود. این می‌تواند به باکتری‌های متفاوت در ریزوسفر مرتبط باشد. خاک ریزوسفر از چهار مکان در غایین، که به خاطر بالاترین کیفیت زعفران شناخته شده است، در زمان برداشت نمونه‌برداری شد. از DNA خاک توالی ژن 16S rRNA هر نمونه با RNASeq برای تحلیل به دست آمد. نتایج نشان داد که باکتری‌هایی مانند Kosakonia، Enterobacter، Salmonella، Plesiomonas، Pasteurella، Lactococcus و Mitsuaria تأثیر قابل توجهی بر افزایش کیفیت زعفران دارند. آن‌ها شناخته شده‌اند که منبع کربن را افزایش می‌دهند، تثبیت نیتروژن، سنتز اکسین، تولید فسفات محلول، تولید γ-آمینوبوتیریک اسید (GABA)، فعالیت آنزیم‌های آنتی‌اکسیدانی را افزایش می‌دهند و محرک‌های رشد گیاه را افزایش می‌دهند؛ و می‌توانند کیفیت متابولیت‌های ثانویه گیاهی در زعفران را بهبود بخشند.

Saffron is the dried stigmas of Crocus sativus (Iridaceae) which is a highly prized aromatic culinary product. Rhizosphere microbiomes are a main factor affecting the production and quality of secondary metabolites and essential oils in culinary herbs, and saffron. We hypothesized the relationship between rhizosphere microbiome and quality indices of saffron (crocin, picrocrocin, and safranal) from Crocus sativus would differ between each location in the Ghayen (Iran) region, using a metabarcoding approach. Despite similar climatic conditions and agricultural practice, the quality of saffron at one location was higher than at the other locations. This can be related to different bacteria in the rhizosphere. Rhizosphere soil from four locations in Ghayen, known for its highest quality saffron, was sampled during harvesting time. From soil DNA the 16S rRNA gene sequence of each sample was obtained by RNASeq for analysis. The results indicated that bacteria such as Kosakonia, Enterobacter, Salmonella, Plesiomonas, Pasteurella, Lactococcus, and Mitsuaria have a significant impact on increasing saffron quality. They are known to increase carbon source, nitrogen fixation, auxin synthesis, dissolved phosphate production, γ-aminobutyric acid (GABA) production, increase the activity of antioxidant enzymes and increase plant growth stimulants; and can improve the quality of plant secondary metabolites in saffron.