تشخیص سرولوژیکی و مولکولی ویروس لکه‌های پیچیده گوجه فرنگی در برخی میزبان‌های علف‌های هرز مزارع زعفران

زعفران یکی از مهم‌ترین محصولات کشاورزی و صادراتی ایران است و شناسایی عوامل کاهش‌دهنده آن اهمیت زیادی دارد. ویروس پیچیدگی خال‌دار گوجه‌فرنگی (TSWV) یکی از ویروس‌های مخرب است. علف‌های هرز گیاهان ذخیره ویروس‌ها هستند. به‌منظور شناسایی و تشخیص TSWV در گیاهان ذخیره، 37 نمونه علف هرز از استان خراسان جنوبی، شامل بیرجند، سرايان، فردوس و قائن در اردیبهشت و خرداد 2017 جمع‌آوری و با روش DAS-ELISA آزمایش شدند. نمونه‌های مثبت در ELISA با استفاده از RT-PCR آزمایش شدند و پرایمرهای خاص ژن نوکلئوپروتئین (N) قطعه‌ای به طول 777 جفت باز تکثیر و توسط شرکت Macrogene تعیین توالی شدند. نتایج نشان دادند که Cardaria draba و Hordeum murinum به TSWV آلوده شده‌اند. در تحلیل فیلوژنتیک با دو ایزوله و 20 ایزوله از بانک ژن، دو گروه شکل گرفتند. دو ایزوله این مطالعه در گروه II و زیرگروه A قرار گرفتند.نزدیک‌ترین نمونه بانک ژنی از مونته‌نگرو (GU339506) با شباهت 97.3٪ در چنوفودیوم کینوا بود و دورترین نمونه از ایتالیا (GU36971) روی نیکوتیانا تباروم به دست آمد. این تحقیق نخستین بررسی علف‌های هرز به عنوان میزبان طبیعی ویروس TSWV در مزارع زعفران خراسان جنوبی بود.

affron is one of the most important crop in agriculture and export of Iran and identification of the reduced agents is important. Tomato spotted wilt virus (SWV) is one of the destructive viruses. Weeds are reservoir plants of viruses. In order to detect and identify the TSWV on reservoir plants, 37 weed samples were collected from South Khorasan, including Birjand, Sarayan, Ferdows and Ghaen during May and April 2017 and were tested by DAS-ELISA. The positive samples in ELISA were tested by RT-PCRand specific primers of Nucleoprotein (N) gene were amplified a fragments with 777 bp length and sequenced by Macrogene company. The results showed that Cardaria draba and Hordeum murinumwere infected by TSWV. In Phylogenetic analysis with two isolates and 20 isolates of gene bank two groups were formed. Two isolates of this study, felt in Group II and subgroup A. The closest gene bank isolate was from Montenegro (GU339506) with 97. 3% on Chenopodium Quinoa and the furthest isolate was from Italy (GU36971) on Nicotiana tabacum. This research was the first survey of weeds as a natural host of TSWV in saffron fields of South Khorasan.