چکیده: هدف: بررسی ترکیبات فعال و مکانیسمهای احتمالی زعفران (Crocus sativus L.) در مهار ضایعات آترواسکلروتیک با استفاده از روش داروشناسی شبکهای. روشها: از پایگاه داده TCMSP برای تحلیل سیستماتیک ترکیبات فعال زعفران استفاده شد. در عین حال، از پایگاههای داده GeneCards و OMIM برای تحلیل ژنها و پروتئینها بر اساس مکانیسم آترواسکلروزیس استفاده شد. تحلیل پیگیری شامل ایجاد شبکهای از دارو-ترکیب-بیماری-هدف بود. اهداف بالقوه برای تعاملات پروتئینی تحلیل شد و تحلیل غنیسازی ژن با استفاده از GO و KEGG انجام شد. داکینگ مولکولی بین ترکیبات مشخص زعفران و اهداف کلیدی آن انجام شد.نتایج: مجموعاً ۵ مؤلفه مؤثر و ۲۷۲ ژن در زعفران شناسایی شدند که شرایط غربالگری آنها بیو دسترسی خوراکی (OB) > ۳۰٪ و شباهت دارویی (DL) > ۰.۱۸ بود.
۲۶ هدف از ترکیبات چندگانه که بهطور همزمان عمل میکردند و ۵۰ هدف از یک ترکیب واحد از شبکه دارو-ترکیب-بیماری-هدف غربالگری شدند. ۱۹ هدف، ۹۹ نتیجه غنیسازی و ۱۱۶ مسیر توسط تعاملات پروتئینی و تحلیل غنیسازی ژن GO و KEGG غربالگری شدند. نتایج دوپینگ مولکولی نشان داد که هر ۵ مؤلفه فعال میتوانند بهطور خودبهخود با VCAM-1 یا eNOS که پروتئینهای نمایندهای از استرس برشی مایع و مسیر آتروسکلروز هستند، متصل شوند. ایزورهمنتین کمترین انرژی اتصالی را با VCAM-1 داشت و کئمفرویل کمترین انرژی اتصالی را با eNOS داشت. نتیجهگیری: نتایج بهطور ابتدایی مؤلفههای اصلی فعالیت و مکانیزم فارماکولوژیکی در زعفران را تأیید کردند و بنیاد خوبی برای مطالعه بیشتر در مورد مکانیزم ضد آتروسکلروزی زعفران فراهم کردند.
AIM: To investigate the active components and potential mechanism of saffron (Crocus sativus L.) in inhibiting atherosclerotic lesion by using network pharmacological method. METHODS: TCMSP database was used to systematically analyze the active components of saffron. At the same time, GeneCards and OMIM databases were used to analyze the genes and proteins according to atherosclerosis mechanism. A follow-up analysis was establishing drug-compound-disease-target network. The potential targets were analyzed for protein interactions, and gene enrichment analysis was carried out by GO and KEGG.
Molecular docking was carried out between characteristic ingredients of saffron and its key targets. RESULTS: A total of 5 effective components and 272 genes were screened in saffron used oral bioavailability (OB)>30% and drug likeness (DL)>0.18 as the screening conditions. 26 targets of multiple compounds acting together and 50 targets of a single compound were screened from drug-compound-disease-target network. 19 targets, 99 enrichment results and 116 pathways were screened by protein interactions, GO and KEGG gene enrichment analysis respectively. Molecular docking results showed that all 5 active components could be bind with spontaneously VCAM-1 or eNOS, which are representative proteins of fluid shear stress and atherosclerosis pathway.
Isorhamnetin had the lowest binding energy with VCAM-1, and kaempferol had the lowest binding energy with eNOS. CONCLUSION: The results preliminarily verified the main activity components and pharmacology mechanism in saffron and provided a good foundation for further study on the antiatherosclerotic mechanism of saffron
- Authors: "M LI, M SI, Z WEN, H SHI, X LI "
- URL: https://manu41.magtech.com.cn/Jweb_clyl/EN/10.12092/j.issn.1009-2501.2020.06.007
- DOI URL: http://dx.doi.org/10.12092/j.issn.1009-2501.2020.06.007
- عنوان مقاله: درمانی
- محور مقاله: "تکنیک نوین (استفاده از فارماکولوژی شبکهای برای کشف مکانیسمهای زعفران) "
- سال انتشار مقاله: 2020
- زبان: انگلیسی
- کشور: چین
- کد مقاله: 20929
- کلمات کلیدی فارسی: "زعفران، آترواسکلروز، فارماکولوژی شبکهای، مکانیسم عمل، ترکیبات زیستفعال "
- کلمات کلیدی انگلیسی: "Saffron, atherosclerosis, network pharmacology, mechanism of action, bioactive compounds "
- لینک کوتاه: https://wikisaffron.org?p=20929
