فراتر از پایگاه داده: تلفیق فارماکولوژی شبکه‌ای و UHPLC-QTOF-MS/MS برای آشکارسازی پتانسیل محافظت عصبی جوشانده «بای‌می» (Bai Mi) در درمان سکته مغزی

فارماکولوژی شبکه‌ای با هدف قرار دادن مسیرهای خاص، در درک چگونگی عملکرد طب سنتی چینی (TCM) نقش مهمی دارد. این مطالعه مکانیسم‌های مختلف را با استفاده از سه رویکرد فارماکولوژی شبکه‌ای، با تمرکز بر عصاره “بای می” (BMD) طب سنتی چینی، بررسی می‌کند. اثرات محافظت عصبی BMD در مدل موش صحرایی مبتلا به انسداد-خونرسانی مجدد شریان مغزی میانی (MCAO/R) ارزیابی شد. ترکیب عصاره BMD (BMDE) و اجزای آن در مغز (BMDB) با استفاده از UHPLC-QTOF-MS/MS، در کنار اجزای مستند شده از پایگاه داده (BMDD) تجزیه و تحلیل شدند. یک تجزیه و تحلیل فارماکولوژیک شبکه‌ای برای بررسی شباهت‌ها و تفاوت‌ها در مکانیسم‌های محافظت عصبی BMD انجام شد. BMD اثر محافظت عصبی قوی در موش‌های MCAO/R نشان داد، همانطور که با نمرات نقص عصبی پایین‌تر، اندازه انفارکتوس مخچه کوچکتر و تغییرات هیستوپاتولوژیک بهبود یافته نشان داده شده است. تجزیه و تحلیل به ترتیب ۴۵، ۱۱ و ۲۲ جزء را در BMDE، BMDB و BMDD با ۲۹، ۲۶ و ۲۳ هدف درمانی بالقوه شناسایی کرد. با این حال، اکثر ترکیبات فهرست‌شده در پایگاه داده در نمونه‌های واقعی یافت نشدند. غنی‌سازی عملکردی و تجزیه و تحلیل شبکه مسیر نشان داد که BMDE و BMDB بیشترین اهداف را به اشتراک می‌گذارند. MAPK1 تنها هدف مشترک در تمام گروه‌ها بود که توسط کروستین، تنها ترکیب مشترک، هدف قرار گرفت. BMD در موش‌های MCAO/R بسیار مؤثر بود، و ترکیبات یافت‌شده در عصاره‌های BMD یا در داخل بدن، مکانیسم‌های دارویی واقعی را بهتر از ترکیبات مشتق‌شده از پایگاه داده منعکس می‌کنند.

Network pharmacology is instrumental in understanding how TCM works by targeting specific pathways. This study examines different mechanisms using three network pharmacology approaches, focusing on the TCM “Bai Mi Decoction” (BMD). The neuroprotective effects of BMD were evaluated in a middle cerebral artery occlusion–reperfusion (MCAO/R) rat model. The composition of BMD extract (BMDE) and its components in brain (BMDB) were analyzed using UHPLC-QTOF-MS/MS, alongside documented constituents from the database (BMDD). A network pharmacological analysis was conducted to explore the similarities and differences in BMD’s neuroprotective mechanisms. BMD showed a strong neuroprotective effect in MCAO/R rats, as indicated by lower neurological deficit scores, smaller cerebellar infarct sizes, and improved histopathological changes. Analysis identified 45, 11, and 22 components in BMDE, BMDB, and BMDD, respectively, with 29, 26, and 23 potential therapeutic targets. However, most database-listed compounds were not found in actual samples. Functional enrichment and pathway network analysis showed that BMDE and BMDB shared the most targets. MAPK1 was the only common target across all groups, targeted by crocetin, the sole shared compound. BMD proved highly effective in MCAO/R rats, with compounds found in BMD extracts or in vivo better reflecting the actual pharmacological mechanisms than database-derived ones.