” بررسی نفوذ ترکیبات زعفران از طریق لایه دوگانه لیپیدی متصل به پروتئین سنبله SARS-CoV-2 با استفاده از شبیه‌سازی دینامیک مولکولی هدایت شده “

“ویروس کرونای شناسایی شده به عنوان COVID-19 عامل شیوع عفونتی است که در دسامبر ۲۰۱۹ آغاز شد. هیچ دارو و درمان کاملاً مؤثری برای این ویروس شناخته نشده است. اخیراً از زعفران و ترکیبات آن برای درمان بیماری‌های ویروسی مختلف استفاده شده است. در این مطالعه، از شبیه‌سازی دینامیک مولکولی هدایت شده برای بررسی اثر چهار ترکیب اصلی زعفران (کروسین، کروستین، سافرانال و پیکروکروسین) به عنوان مولکول‌های کاندیدای دارویی بر روی COVID-19 استفاده شد. انرژی‌های اتصال بین مولکول‌های دارویی و پروتئین سنبله و پروتئاز اصلی ویروس ارزیابی شد.

نتایج به دست آمده نشان داد که کروستین میل بالایی به پروتئین سنبله و همچنین پروتئاز اصلی ویروس دارد. همچنین، محاسبات مکانیک کوانتومی نشان داد که کروستین می‌تواند با گشتاور دوقطبی و قطبش پذیری قوی، بر مانع انرژی لایه دوگانه لیپیدی غلبه کند. ویژگی‌های فارماکوکینتیک و ADMET ثابت کرد که کروستین می‌تواند یک کاندیدای دارویی مناسب باشد. بنابراین، کروستین می‌تواند یک داروی امیدوارکننده برای درمان COVID-19 باشد.

A coronavirus identified as COVID-19 is the reason for an infection outbreak which started in December 2019. No completely effective drugs and treatments are recognized for this virus. Recently, saffron and its compounds were used to treat different viral diseases. In this study, the steered molecular dynamics simulation was used for investigating the effect of four main components of saffron (crocin, crocetin, safranal, and picrocrocin) as candidate drug molecules on COVID-19. The binding energies between drug molecules and spike protein and the main protease of the virus were evaluated. The obtained results demonstrated that crocetin has a high affinity towards spike protein and also the main protease of the virus. Also, quantum mechanics calculations elucidated that crocetin could overcome the energy barrier of the lipid bilayer with strong dipole moment and polarizability. The pharmacokinetic and ADMET properties proved that crocetin could be a suitable drug candidate. So, crocetin could be a promising drug for treatment of COVID-19.