مکانیسم‌های زعفران در درمان آترواسکلروز بر اساس فارماکولوژی شبکه

هدف: بررسی مسیرهای اصلی و مکانیزم‌های احتمالی اثر زعفران در ضد آترواسکلروز (AS) با استفاده از فارماکولوژی شبکه‌ای.

روش‌ها: ترکیبات فعال و پروتئین‌های هدف دارو از پایگاه داده TCMSP به دست آمدند و نام ژن‌های مربوط به پروتئین‌های هدف با استفاده از پایگاه داده Uniprot جستجو شد تا اهداف انسانی تحت تنظیم زعفران به دست آیند. اهداف انسانی AS از پایگاه داده DisGeNET و مقالات قبلی استخراج شدند. ژن هدف زعفران با ژن هدف AS تلاقی داده شد تا ژن هدف زعفران برای AS به دست آید. با کمک نرم‌افزار Cytoscape3.7.2، شبکه تعامل بین ترکیبات فعال زعفران و اهداف احتمالی، و شبکه تعامل بین ترکیبات فعال زعفران و اهداف بیماری AS ساخته شد، و اهداف اصلی نقش زعفران در بیماری AS از طریق ارزیابی ویژگی‌های توپولوژیکی شبکه مانند درجه شناسایی شدند؛ افزونه ClueGo در نرم‌افزار Cytoscape3.7.2 برای تحلیل فرآیندهای زیستی GO و مسیرهای متابولیک KEGG استفاده شد.

نتایج: با در نظر گرفتن خاصیت دارویی ≥0.18 به عنوان شرط محدودکننده و جستجو و بررسی مطالعات پیشین، 22 ترکیب به‌دست آمد. در مجموع 106 پروتئین هدف تحت تاثیر زعفران و 117 هدف AS شناسایی شدند. تقاطع‌ها انتخاب شد تا 26 هدف زعفران برای AS به دست آید. بر اساس درجه شبکه هدف-ترکیب کاندید دارویی-AS، اجزای اصلی موثر زعفران در مقابله با AS شامل کروستین، ایزورامنیتین و کوئرستین بودند. مجموعاً 26 هدف ژنی با استفاده از تحلیل غنی‌سازی KEGG با نرم‌افزار ClueGo در Cytoscape3.7.2 مورد بررسی قرار گرفت تا مسیرهای مرتبط با درمان AS با زعفران شناسایی شود. با استفاده از پایگاه داده KEGG و مشاوره با مطالعات پیشین، نموداری شماتیک از مسیرهای مرتبط با اثر ضد-AS زعفران ارائه شد.

نتیجه‌گیری: اثر ضد-AS زعفران ممکن است عمدتاً به کروستین، ایزورامنیتین و کوئرستین موجود در زعفران نسبت داده شود، که اثرات ضدالتهابی و مهار رگ‌زایی دارند و بدین ترتیب اثر ضد-AS را ایجاد می‌کنند.

Objective： To explore the main pathways and possible mechanisms of saffron in anti-atherosclerosis （AS） using network pharmacology.

Methods： The active ingredients and target proteins of the drug were obtained from the TCMSP database， and the gene names corresponding to the target proteins were searched using the Uniprot database to obtain human targets regulated by saffron. Human targets of AS were obtained from DisGeNET database and previous literature. The target gene of saffron was intersected with the target gene of AS to obtain the target gene of saffron for AS. With the help of Cytoscape3.7.2 software， a saffron active ingredient-potential target， saffron active ingredient-AS disease target interaction network was constructed， and the core targets of saffron’s role in AS disease were screened out through evaluation of network topological characteristics such as degree； The ClueGo plug-in in Cytoscape3.7.2 software was used to analyze GO biological processes and KEGG metabolic pathways of targets.

Results： With the drug-like property ≥0.18 as the limiting condition and previous literature search and screening， 22 compounds were obtained. A total of 106 saffron-regulated target proteins， and 117 AS targets were obtained. The intersections were selected to obtain 26 saffron targets for AS. According to the degree of drug-candidate component-AS candidate target network， the main effective components of saffron anti-AS were crocetin， isorhamnetin and quercetin. A total of 26 gene targets were analyzed by KEGG enrichment using the ClueGo in Cytoscape3.7.2 software to obtain pathways related to saffron treatment of AS. Using the KEGG database and consulting previous literature， a schematic diagram of the related pathways of saffron anti-AS was obtained.

Conclusion： The anti-AS of saffron may be mainly attributed to crocetin， isorhamnetin and quercetin in saffron， which exert anti-inflammatory and inhibit angiogenesis effects， thereby achieving anti-AS effect.