رمزگشایی تحلیل تنوع ژنتیکی زعفران با استفاده از نشانگرهای RAPD و ISSR

وجود تنوع ژنتیکی در گیاه زعفران (Crocus sativus) تا به امروز در سطح جهانی یک معما باقی مانده است. این مطالعه پروفیل تکثیر DNA مبتنی بر PCR در زعفران را با استفاده از پرایمرهای ISSR و RAPD بررسی کرده است. در مجموع 38 آمپلیکون توسط پرایمرهای ISSR تولید شد که تعداد آن‌ها بین 7 تا 12 بود و به طور متوسط 9.50 باند در هر پرایمر مشاهده شد. 20 باند پلی‌مورفیک و 18 باند مونو‌مورفیک بودند و میانگین درصد پلی‌مورفیسم 52.48٪ گزارش شد. تکثیر مبتنی بر RAPD مجموعاً 161 آمپلیکون را نشان داد که 107 آمپلیکون پلی‌مورفیک و 54 آمپلیکون مونو‌مورفیک بودند و میانگین درصد پلی‌مورفیسم 66.44٪ بود.

نتایج تجمعی RAPD و ISSR نشان داد که شاخص شباهت Nei-Li بین 0.70 و 0.97 قرار دارد. نتایج AMOVA نشان داد که 9٪ واریانس بین جمعیت‌ها و 91٪ واریانس درون جمعیت‌ها وجود دارد، Φ PT برابر با 0.089 بود که نشان‌دهنده وجود تفاوت‌های ژنتیکی هرچند محدود است.در نتیجه، نتایج نشان می‌دهد که نمونه‌های زعفران تفاوت ژنتیکی کمی دارند، که می‌توان از آن در برنامه‌های بهبود نسل‌های آینده برای ارتقای این محصول گرانبها بهره برد.

The existence of genetic diversity in Crocus sativus has globally remained a mystery till date. The study investigated PCR based DNA amplification profile of saffron using ISSR and RAPD based primers. A total of 38 amplicons were generated by ISSR primers in the range from 7 to 12 with an average of 9.50 bands per primer. 20 bands were found to be polymorphic and 18 were monomorphic with an average percentage of polymorphism as 52.48%. RAPD based amplification revealed a total 161 amplicons, 107 as polymorphic and 54 as monomorphic with an average percentage of polymorphism as 66.44%.

Cumulative results of RAPD and ISSR demonstrated that Nei-Li’s similarity index ranged between 0.70 and 0.97. The results of AMOVA has revealed 9% of variance among populations and 91% of variance within populations, Φ PT was found as 0.089, which indicates existence of genetic differences though limited. In conclusion, the results indicate that saffron accessions are minimally genetically differentiated, which could be capitalized in future breeding programmes to ameliorate this precious crop.