شناسایی نشانگرهای ISSR مرتبط با صفات کمی اکوتپ‌های زعفران زراعی

به منظور بررسی رابطه بین صفات کمی و نشانگرهای ISSR، یک آزمایش تحت شرایط مزرعه و آزمایشگاهی در دانشگاه زنجان انجام شد. در این آزمایش، از ۲۰ پرایمر نشانگر ISSR استفاده شد و صفات زراعی (شامل تعداد گل، وزن تازه پرچم، وزن تازه گل، وزن خشک پرچم، وزن خشک گل، طول پرچم، عملکرد زعفران، تعداد پیازک، وزن تازه و خشک پیازک، تعداد برگ‌ها، طول برگ، عرض برگ، سطح برگ، وزن خشک برگ، بیوماس، شاخص برداشت)، صفات فیزیولوژیکی (نرخ تعرق، هدایت روزنه‌ای، فتوسنتز) و متابولیت‌های ثانویه (پیکوکروسین، سافرنال و کروکین) در طول فصل رشد اندازه‌گیری شدند.

سه پرایمر از کل پرایمرها تکثیر نشدند. ۱۷ پرایمر ISSR تعداد ۱۳۳ لوکوس را در بین ۲۰ اکوتیپ زعفران تکثیر کردند، با میانگین ۷٫۸۲ لوکوس در هر پرایمر. بالاترین تعداد آلل‌ها مربوط به پرایمر I-8 بود (۱۵ آلل).. با این حال، بیشترین مقدار هتروزیگوتی و محتوای اطلاعات پلی‌مورفیسم در لوکوس I-7 یافت شد که برابر با 0.93 بود. نتایج تحلیل رگرسیون مرحله‌ای نشان داد که پرایمرهای مورد مطالعه (یعنی نه پرایمر) با اکثر صفات رابطه قابل‌توجهی داشتند به جز وزن تازه گل، سافرنال، کروکین، تعداد کورم‌ها و نرخ تعرق. بالاترین ضریب تعیین مربوط به صفات عمل‌آوری بود (79٪)، وزن خشک برگ (76٪)، تعداد گل (73٪) و سطح برگ (70٪) به ترتیب. لوکوس I-6 با نه صفت کمی مرتبط بود که بیشترین رابطه را در میان پرایمرهای مورد مطالعه با صفات کمی داشت.

این پرایمر با وزن تازه پرچم، وزن خشک پرچم، وزن تازه و خشک کورم، تعداد برگ، سطح برگ، وزن خشک برگ، هدایت روزنه‌ای و فتوسنتز مرتبط بود.این پرایمر (I-6)، 11 آلل در جمعیت مورد مطالعه نشان داد، که می‌توان آن‌ها را به‌عنوان پرایمرهای مهم در ارتباط با صفات کمّی در نظر گرفت. پرایمرهای U808 و U834 به‌ترتیب با 5 و 4 صفت مرتبط بودند، که پس از پرایمر I-6 بیشترین ارتباط را با صفات کمّی داشتند. این پرایمرها با تعداد گل‌ها، شاخص برداشت و عملکرد مرتبط بودند. با توجه به رابطه مشاهده‌شده، می‌توان از این نواحی نشانگر برای انتخاب اکوتیپ‌ها بر اساس صفات مرتبط در جمعیت‌های زعفران استفاده کرد.

“In order to investigate the relationship between quantitative traits and ISSR markers, an experiment was carried out under farm and laboratory conditions at the Zanjan University. In this experiment, 20 primers of ISSR marker were used, and the agronomic traits (including flower number, fresh weight of Stigma, fresh weight of flower, dry weight of Stigma, dry weight of flower, stigma length, saffron yield, corm number, fresh and dry weight of corm, number of leaves, leaf length, leaf width, leaf area, dry leaf weight, biomass, harvest index), physiological traits (transpiration rate, stomatal conductance, photosynthesis) and secondary metabolites (Picocrocin, Safranal, and Crocin) were measured during the growing season.

Three primers of the total did not amplify. 17 ISSR primers amplified 133 loci among 20 saffron ecotypes, with an average of 7.82 loci per primer. The highest number of alleles were for the I-8 primer (15 alleles). However, the highest amount of heterozygosity and polymorphism information content was found at the I-7 locus, which was 0.93. The results of stepwise regression analysis showed that the primers studied (i.e., nine primers) had a significant relationship with most traits except the fresh weight of flower, saffranal, crocin, corm number, and transpiration rate. The highest coefficient of determination was related to yield traits (79%), dry leaf weight (76%), flower number (73%), and leaf area (70%), respectively. I-6 locus was associated with nine quantitative traits, which had the highest relationship among studied primers with quantitative traits.

This primer was associated with the fresh weight of stigma, dry weight of stigma, fresh and dry weight of corm, leaf number, leaf area, dry leaf weight, stomatal conductance, and photosynthesis. This primer (I-6), showed 11 alleles in the studied population, which can be considered as important primers in relation to quantitative traits. U808 and U834 primers were associated with 5 and 4 traits, respectively, which had the highest association with quantitative traits after the I-6 primer. These primers were associated with the number of flowers, harvest index, and yield. Considering the observed relationship, it is possible to use these markers loci to select ecotypes based on the related traits in saffron populations.”