تنوع قارچی روی سطح کورم‌های زعفران با ویژگی‌های رشد مختلف

زعفران یکی از گران‌ترین ادویه‌ها است و از نظر مواد فعال دارویی و بیولوژیکی غنی است. ما ساختار جامعه و تنوع قارچ‌هایی که بر سطح غده‌های زعفران با ویژگی‌های رشد متفاوت رشد می‌کنند را بررسی کردیم. سی نمونه غده با ویژگی‌های رشد متفاوت، یعنی آلوده، قادر به جوانه زدن نبود، قادر به جوانه زدن ولی گل نداد، قادر به جوانه زدن و تولید یک گل در هر غده، و قادر به جوانه زدن و تولید دو گل در هر غده، از پارک کشاورزی دریاچه جنوبی تای، بیمارستان مرکزی هوجو جمع‌آوری شد. روش نسل بعدی توالی‌یابی (NGS) برای شناسایی RNA ریبوزومی فضای داخلی ترانسکریپت شده (ITS) در قارچ به کار گرفته شد.

ساختار جامعه قارچ‌ها در سطح غده‌های با ویژگی‌های رشد متفاوت با استفاده از ابزارهای بیوانفورماتیکی شرح داده شد و قارچ خاص سطح غده شناسایی شد. قارچ‌ها در سطح غده‌ها ویژگی‌های رشدی متفاوتی نشان دادند.وفور Trichocomaceae و Talaromyces در ساقه‌های کُم آلوده زیاد بود، در حالی که وفور Aspergillaceae در ساقه‌هایی که قادر به سبز شدن نبودند، بالا بود. Penicillium و Dothideomycetes در ساقه‌هایی که قادر به سبز شدن ولی قادر به گلدهی نبودند، و در ساقه‌هایی که قادر به سبز شدن و تولید دو گل در هر ساقه بودند، به ترتیب مشاهده شدند. تفاوت‌هایی در Cladosporium، Lambertella، Passalora، Penicillium و Talaromyces در میان پنج گروه در سطح جنس مشاهده شد. درک تنوع قارچی روی سطح ساقه ممکن است اطلاعات مفیدی برای بهبود سبز شدن و گلدهی ساقه‌های زعفران ارائه دهد.

Saffron is one of the most expensive spices and is rich in pharmacological and biological active ingredients. We explored the community structure and diversity of the fungi growing on the surface of saffron corms having different growth characteristics. Thirty corm samples having different growth characteristics, i.e., infected, unable to germinate, able to germinate but not bloom, able to germinate and produce one flower per corm, and able to germinate and produce two flowers per corm, were collected from South Tai Lake Agricultural Park, Huzhou central hospital. The next-generation sequencing (NGS) method was employed to detect the internal transcribed spacer (ITS) ribosomal RNA in fungus.

The community structure of fungi on the surface of corms having different growth characteristics was described using bioinformatics tools, and the specific fungus on the corm surface was identified. The fungi on the surface of corms exhibited different developmental features. The abundance of Trichocomaceae and Talaromyces was high in infected corms, whereas that of Aspergillaceae was high in corms that were unable to germinate. Penicillium and Dothideomycetes were observed in corms that could germinate but not bloom, and in corms that could germinate and produce two flowers per corm, respectively. Differences were observed in Cladosporium, Lambertella, Passalora, Penicillium, and Talaromyces among the five groups at the genus level. An understanding of the fungal diversity on the corm surface might provide useful information for improving germination and blooming of saffron corms.