تنوع ژنتیکی جدایه‌های Pseudomonas fluorescens جمع‌آوری شده از برنج باسماتی و محصولات زعفران منطقه هیمالیا شمال غربی

Pseudomonas fluorescens در طبیعت همه‌جا وجود دارد و دارای مکانیسم‌های متنوع عمل است که استرس‌های زیستی و غیرزیستی را کاهش می‌دهد و فعالیت‌های ترویج رشد گیاه در محصولات کشاورزی دارد. از میان پنجاه ایزوله از پسودومونادهای فلورسانت جمع‌آوری‌شده از محصولات زعفران و برنج، سی و پنج ایزوله بر اساس آزمایش‌های فنوتیپی و PCR خاص گونه به‌عنوان P. fluorescens شناسایی شدند. آزمایش PCR خاص گونه یک جایگزین سریع، اختصاصی و حساس برای روش‌های کشت سنتی در شناسایی P. fluorescens ارائه داد. تحلیل خوشه‌ای سی و پنج ایزوله جمع‌آوری شده P. fluorescens با استفاده از rep-PCR تنوع ژنتیکی قابل توجهی را نشان داد. الگوهای باندی بیست و بیست و یک برای پرایمرهای BOX و REP به دست آمد. مطالعه حاضر برای مرتبط ساختن تنوع ژنتیکی با تنوع عملکردی P. fluorescens و بررسی امکان استراتژی‌های مدیریت بیماری مناسب برای یک محصول خاص در کشاورزی پایدار مفید خواهد بود.

Pseudomonas fluorescens is ubiquitous in nature and having diverse mechanism of action which ameliorates the biotic and abiotic stresses and possess plant growth promotion activities in agricultural crops. Out of fifty isolates of fluorescent pseudomonads collected from saffron and paddy crops, thirty-five isolates were identified as P. fluorescens on the basis of phenotypic test and species-specific PCR. Species-specific-PCR assay provided a rapid, specific and sensitive alternative to conventional culture methods for the identification of P. fluorescens. Cluster analysis of the collected thirty-five isolates of P. fluorescens by rep-PCR showed considerable genetic diversity. Twenty and twenty-one banding patterns were obtained for both the BOX and REP primers. The present study shall be useful to correlate the genetic diversity with functional diversity of P. fluorescens to explore the possibilities of suitable disease management strategies for a particular crop in sustainable agriculture.