An iteratively optimised process for improving the efficiency and effectiveness of an industrial SARS-CoV-2 diagnostic facility

در ۱۱ مارس ۲۰۲۰، دولت بریتانیا برنامه‌هایی برای گسترش آزمایش کووید-۱۹ اعلام کرد و در ۲۷ مارس ۲۰۲۰ اعلام شد که یک اتحاد جدید از آزمایشگاه‌های مشترک بخش خصوصی و دانشگاهی برای ایجاد ظرفیت آزمایشی مورد نیاز تشکیل می‌شود. مرکز آزمایش کووید-۱۹ کمبریج (CCTC) در طول آوریل ۲۰۲۰ از طریق همکاری بین AstraZeneca، GlaxoSmithKline و دانشگاه کمبریج تأسیس شد، که در پایان ژوئیه ۲۰۲۰، Charles River Laboratories نیز به این همکاری پیوست. عملیات آزمایشگاهی CCTC بر استفاده بهینه از اتوماسیون، معرفی فناوری‌های نوین و مدل‌سازی فرآیندها متمرکز بود تا ظرفیت آزمایش روزانه ۲۲٬۰۰۰ تست را فراهم کند.در اینجا ما به بهینه‌سازی فرآیند آزمایشگاهی از طریق بهره‌برداری مداوم از معیارهای عملکرد داخلی می‌پردازیم، در حالی که فناوری‌های جدیدی از جمله غیرفعال‌سازی حرارتی نمونه‌های بالینی هنگام دریافت در آزمایشگاه و پروتکل مستقیم به PCR را معرفی می‌کنیم که نیاز به مرحله استخراج RNA را حذف می‌کند. ما انتظار داریم این روش‌ها در افزایش ادامه بهره‌وری و اثربخشی در تمام آزمایشگاه‌های بزرگ تشخیص ویروس‌ها ارزشمند باشند.

On 11th March 2020, the UK government announced plans for the scaling of COVID-19 testing, and on 27th March 2020 it was announced that a new alliance of private sector and academic collaborative laboratories were being created to generate the testing capacity required. The Cambridge COVID-19 Testing Centre (CCTC) was established during April 2020 through collaboration between AstraZeneca, GlaxoSmithKline, and the University of Cambridge, with Charles River Laboratories joining the collaboration at the end of July 2020. The CCTC lab operation focused on the optimised use of automation, introduction of novel technologies and process modelling to enable a testing capacity of 22,000 tests per day. Here we describe the optimisation of the laboratory process through the continued exploitation of internal performance metrics, while introducing new technologies including the Heat Inactivation of clinical samples upon receipt into the laboratory and a Direct to PCR protocol that removed the requirement for the RNA extraction step. We anticipate that these methods will have value in driving continued efficiency and effectiveness within all large scale viral diagnostic testing laboratories.