بررسی چشم انداز ویروسی زعفران از طریق تجزیه و تحلیل متاترانسکریپتومی

زعفران (Crocus sativus L.)، یک محصول تاریخی مهم که به دلیل خواص مغذی آن ارزش دارد، از دیدگاه بهداشت گیاهی مورد بررسی قرار نگرفته است. این مطالعه یک بررسی کامل از ویروس‌های مؤثر بر نمونه‌های زعفران از ارقام اسپانیایی را با استفاده از توالی‌یابی با کارایی بالا در کنار یک بررسی سیستماتیک از مجموعه داده‌های رونویسی از Crocus sativus در آرشیو Sequence Read انجام داد. تجزیه و تحلیل ما تنوع و فراوانی گسترده ای را نشان داد و 17 ویروس را در 52 کتابخانه تجزیه و تحلیل شده شناسایی کرد که برخی از آنها بسیار رایج بودند.

این شامل ویروس های شناخته شده آلوده کننده زعفران و ویروس هایی است که قبلا گزارش نشده است. علاوه بر این، ما 7 ویروس جدید از خانواده‌های Alphaflexiviridae، Betaflexiviridae، Potyviridae، Solemoviridae، و Geminiviridae را کشف کردیم که برخی از آنها در کتابخانه‌ها از مکان‌های مختلف وجود دارند. این یافته‌ها نشان می‌دهد که ویروم مرتبط با زعفران پیچیده‌تر از آنچه قبلاً گزارش شده است، بر پتانسیل تجزیه و تحلیل گیاه‌پزشکی برای افزایش بهره‌وری زعفران تأکید می‌کند.

Saffron (Crocus sativus L.), a historically significant crop valued for its nutraceutical properties, has been poorly explored from a phytosanitary perspective. This study conducted a thorough examination of viruses affecting saffron samples from Spanish cultivars, using high-throughput sequencing alongside a systematic survey of transcriptomic datasets from Crocus sativus at the Sequence Read Archive. Our analysis unveiled a broad diversity and abundance, identifying 17 viruses across the 52 analyzed libraries, some of which were highly prevalent.

This includes known saffron-infecting viruses and previously unreported ones. In addition, we discovered 7 novel viruses from the Alphaflexiviridae, Betaflexiviridae, Potyviridae, Solemoviridae, and Geminiviridae families, with some present in libraries from various locations. These findings indicate that the saffron-associated virome is more complex than previously reported, emphasizing the potential of phytosanitary analysis to enhance saffron productivity.