جداسازی، شناسایی و تعیین پاتوژنیسیته عوامل ایجادکننده پوسیدگی کرم زعفران (Crocus sativus L.) در دره اوکو، آرژانتین

زعفران (Crocus sativus L.) فرصتی جذاب برای تنوع بخشیدن به تولید و ارزش افزوده، به ویژه برای تولیدکنندگان در مقیاس کوچک و کشاورزی مبتنی بر خانواده است. با این حال، تکثیر آگامیک محصول از طریق بنه، نگرانی هایی را در مورد پراکندگی بیماری ایجاد می کند. در طول تابستان 2013 و 2015، علائم پوسیدگی بنه در محصولات زعفران در La Consulta، Valle de Uco، آرژانتین مشاهده شد. این علائم به صورت پژمرده شدن گیاهان و نواحی قرمز رنگ در سطح بنه ها ظاهر می شود که در برخی موارد مناطق عمیق تری را تحت تأثیر قرار می دهد. این مطالعه با هدف جداسازی و شناسایی عامل ایجاد کننده پوسیدگی بنه زعفران و همچنین مقایسه بیماریزایی چهار سویه جدا شده از گیاه زعفران انجام شد.

جداسازی مداوم Fusarium spp. کلنی های بنه های مبتلا ارتباط آن را با این بیماری تایید کردند. جدایه‌های به‌دست‌آمده به بنه‌های سالم تلقیح شدند و تولید مثل علائم و همچنین جداسازی مجدد پاتوژن بعدی تایید شد. خصوصیات مورفولوژیکی و مولکولی سویه ها با استفاده از توالی یابی ژن rDNA انجام شد. علاوه بر این، پیشرفت بیماری با مدل‌های اپیدمیولوژیک متناسب با داده‌های تجربی، که به‌عنوان برآوردگر پرخاشگری سویه‌های قارچی عمل می‌کردند، ارزیابی شد.

نتایج به طور قطعی Fusarium oxysporum Schltdl را شناسایی کرد. به عنوان عامل پوسیدگی بنه، و تغییرات در حدت در بین سویه های گیاه میزبان مشاهده شد. پس از مطالعات پایه مولکولی و پاتولوژیک، فرض بر این است که گونه‌های قارچی احتمالاً متعلق به فرم تخصصی گلادیولی هستند، اما مطالعات بیشتری برای تأیید آن ضروری است. مطالعه حاضر یافته‌هایی را ارائه می‌کند که اهمیت تشخیص زودهنگام و حفظ مزارع عاری از بیماری‌زا را برای حفظ کشت زعفران نشان می‌دهد. این یافته‌ها ممکن است گام اولیه برای پروژه‌های آینده با هدف درک بهتر اپیدمیولوژی بیماری، تعیین گونه/نژاد پاتوژن، و توسعه استراتژی‌های مدیریت مؤثر باشد.

Saffron (Crocus sativus L.) presents an attractive opportunity for diversifying production and adding value, particularly for small-scale growers and family-based agriculture. However, the agamic propagation of the crop through corms raises concerns regarding disease dispersion. During the summers of 2013 and 2015, symptoms of corm rot were observed in saffron crops in La Consulta, Valle de Uco, Argentina. These symptoms manifested in the form of wilting plants and red-coloured areas on the surface of the corms, in some cases affecting deeper regions.

This study aimed to isolate and identify the causal agent responsible for saffron corm rot while also comparing the virulence of four strains isolated on saffron plants. Consistent isolation of Fusarium spp. colonies from affected corms confirmed its association with the disease. The obtained isolates were inoculated into healthy corms, and the reproduction of symptoms was confirmed, as well as subsequent pathogen re-isolation. Morphological and molecular characterisation of the strains was performed using rDNA gene sequencing.

Furthermore, disease progression was assessed with fitting epidemiological models to empirical data, which served as estimators of fungal strain aggressiveness. The results conclusively identified Fusarium oxysporum Schltdl. as the causal agent of corm rot, and variations in virulence were observed among the strains on the host plant. After basic molecular and pathological studies, it is postulated that the fungal strains possibly belong to the forma specialis gladioli, but further studies are necessary to confirm that.

The present study provides findings that highlight the importance of early detection and the preservation of pathogen-free fields to sustain saffron cultivation. These findings may constitute the initial step for future projects aimed at understanding the epidemiology of the disease better, determining the species/races of the pathogen, and developing effective management strategies.