"Transcriptome profiling of the flowering transition in saffron (Crocus sativus L.) "

“پروفایل‌یابی ترانسکریپتوم گذار گلدهی در زعفران “

بروزرسانی مهر 10, 1404

ثبت کننده سارا کردستانی

تعداد بازدید 95

زعفران که از کلاله گیاه Crocus sativus به دست می‌آید، نه تنها داروی سنتی ارزشمندی در طب چینی است بلکه ادویه و رنگ‌زن گران‌قیمتی نیز محسوب می‌شود. بازده و کیفیت آن به طور جدی تحت تاثیر انتقال گل‌دهی قرار دارد. با این حال، مکانیزم تنظیم مولکولی انتقال گل‌دهی در C. sativus هنوز ناشناخته است.

در این مطالعه، ما تجزیه و تحلیل‌های مورفولوژیکی، فیزیولوژیکی و ترنسکریپتومی را با استفاده از نمونه‌های جوانه‌های اپیکال C. sativus در طول فرآیند انتقال گل‌دهی انجام دادیم. نتایج مورفولوژیکی نشان داد که فرآیند انتقال گل‌دهی می‌تواند به سه مرحله تقسیم شود: دوره غیردیفرانسیه‌شده، دوره اولیه تمایز جوانه‌های گل و دوره پایانی تمایز جوانه‌های گل.مقادیر قند، گیبرلین (GA3)، اوکسین (IAA) و زئاتین (ZT) به طور مداوم افزایش یافتند، در حالی که مقادیر نشاسته و اسید آبسیزیک (ABA) به تدریج کاهش پیدا کردند.

تحلیل ترنسکریپتومیک نشان داد که در مجموع 60203 یونژن شناسایی شدند که از بین آنها 19490 به طور قابل توجهی بیان متفاوتی داشتند. از این تعداد، 165 یونژن در فرآیند گلدهی دخیل بودند و به طور قابل توجهی در متابولیسم قند، سیگنال رسانی هورمونی، تنظیم چرخه سلولی، دوره نوری و مسیرهای خودمختار غنی شده بودند. بر اساس تحلیل فوق، یک مدل فرضی برای شبکه‌های تنظیمی انتقال گلدهی زعفران پیشنهاد شد. این مطالعه پایبندی نظری برای تنظیم ژنتیکی گلدهی در C. sativus ایجاد می‌کند.

Saffron, derived from the stigma of Crocus sativus, is not only a valuable traditional Chinese medicine but also the expensive spice and dye. Its yield and quality are seriously influenced by its flowering transition. However, the molecular regulatory mechanism of the flowering transition in C. sativus is still unknown. In this study, we performed morphological, physiological and transcriptomic analyses using apical bud samples from C. sativus during the floral transition process.

Morphological results indicated that the flowering transition process could be divided into three stages: an undifferentiated period, the early flower bud differentiation period, and the late flower bud differentiation period. Sugar, gibberellin (GA3), auxin (IAA) and zeatin (ZT) levels were steadily upregulated, while starch and abscisic acid (ABA) levels were gradually downregulated. Transcriptomic analysis showed that a total of 60 203 unigenes were identified, among which 19 490 were significantly differentially expressed.

Of these, 165 unigenes were involved in flowering and were significantly enriched in the sugar metabolism, hormone signal transduction, cell cycle regulatory, photoperiod and autonomous pathways. Based on the above analysis, a hypothetical model for the regulatory networks of the saffron flowering transition was proposed. This study lays a theoretical basis for the genetic regulation of flowering in C. sativus.

  • Authors: Jing Hu , Yuping Liu , Xiaohui Tang , Huajing Rao, Chaoxiang Ren , Jiang Chen , Qinghua Wu , Yi Jiang, Fuchang Geng , Jin Pei
  • URL: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32541892/
  • DOI URL: https://doi.org/10.1038/s41598-020-66675-6
  • عنوان مقاله: ترکیب شیمیایی
  • محور مقاله: "تکنیک نوین (ترانسکریپتومیکس) "
  • افیلیشن نویسنده مسئول: State Key Laboratory of Traditional Chinese Medicine Resources Research and Development, Chengdu University of Traditional Chinese Medicine, Chengdu, 611137, China
  • ایمیل نویسنده فقط برای کاربران ورود / عضویت
  • سال انتشار مقاله: 2020
  • زبان: انگلیسی
  • کشور: چین
  • کد مقاله: 21470
  • کلمات کلیدی فارسی: "زعفران، ترانسکریپتوم، گذار گلدهی، بیان ژن، توالی‌یابی RNA "
  • کلمات کلیدی انگلیسی: "Saffron, Crocus sativus, Transcriptome, Flowering transition, Gene expression, RNA-seq "
  • لینک کوتاه: https://wikisaffron.org?p=21470

دیدگاهتان را بنویسید

نشانی ایمیل شما منتشر نخواهد شد. بخش‌های موردنیاز علامت‌گذاری شده‌اند *