ارزیابی مکانیسم مولکولی خاصیت ضد استرس زعفران

پیش‌زمینه و اهداف: اسناد متعددی درباره خواص محافظتی زعفران در برابر شرایط استرس وجود دارد که به اثر زعفران بر الگوی بیان ژن نمونه‌های درمان‌شده اشاره می‌کنند. هدف از مطالعه حاضر تعیین پروتئین‌های اصلی تنظیم‌شده توسط عصاره زعفران بود.

روش‌ها: بیست پروتئین با بیان متفاوت از یک تحقیق منتشر شده از طریق تحلیل شبکه مورد بررسی قرار گرفت و با استفاده از نرم‌افزار Cytoscape و افزونه Cetoscape برای تعیین پروتئین‌های کلیدی تنظیم‌شده ارزیابی شدند. شبکه با استفاده از برنامه Network Analyzer نرم‌افزار Cytoscape تحلیل شد و گره‌های مرکزی شناسایی شدند.

نتایج: بیست پروتئین مورد بررسی در شبکه‌ای شامل ۹۰۰۵ گره و ۱۱۴۴۶ اتصال قرار گرفتند. تحلیل شبکه نشان داد که پروتئین‌های VCP، SOD1، GRP78 (HSPA5)، GRP75 (HSPA9)، PRDX1، PHB، COMT و ATP5H پروتئین‌های مرکزی هستند که توسط عصاره زعفران تنظیم می‌شوند.

نتیجه‌گیری: بر اساس پروتئین‌های تنظیم‌شده، تنظیم میتوکندری و شبکه آندوپلاسمی به عنوان هدف اصلی زعفران در مدیریت استرس شناسایی شد

“Background and objectives: There are several documents about protective properties of saffron against stress conditions which refer to the effect of saffron on gene expression pattern of the treated samples. The aim of the present study was determination of the main regulated proteins by saffron extract.

Methods: Twenty differentially expressed proteins from a published research were investigated via network analysis and assessed to determine the crucial regulated individuals by Cetoscape software. The network was analyzed by network analyzer application of Cytoscape software, and the central nodes were identified.

Results: Twenty queried proteins were included in a network with 9005 nodes and 11446 edges. Analysis of the network revealed that VCP, SOD1, GRP78 (HSPA5), GRP75 (HSPA9), PRDX1, PHB, COMT, and ATP5H are the central proteins which are regulated by saffron extract.

Conclusion: Based on the regulated proteins, regulation of mithoconderia and endoplasmic reticulum was identified as the main target of saffron in stress management”