{فصل کتاب} – بینش‌های کالترومیک و متابارکودیک در مورد ارتباط زعفران و میکروبیوم

میکروبیوم مرتبط با زعفران با هر دو رویکرد وابسته به کشت، یعنی کالتورومیک، و مستقل از کشت، یعنی متابارکودیک، مورد مطالعه قرار گرفته است. میکروبیوم عمدتاً از ریشه تا بنه مورد مطالعه قرار گرفته است، اما گزارش‌های کمی در مورد میکروبیوم مرتبط با برگ‌ها، پرچم، گلبرگ، کلاله و غیره وجود دارد. محققان در درجه اول تنوع را مطالعه کرده‌اند و همزمان سعی کرده‌اند میکروب‌های محرک رشد گیاه مرتبط با زعفران را با استفاده از تکنیک کالتورومیک جدا کنند. کالتورومیک همچنین برای جداسازی و توصیف اندوفیت‌ها و عوامل بیماری‌زای زعفران استفاده شده است. مطالعه متابارکودیک روی زعفران آغاز شده و عمدتاً در آزمایشگاه ما انجام شده است و تنها یک گزارش از چین وجود دارد. باکتریوم و مایکوبیوم بخش‌های زیرزمینی زعفران با تجزیه و تحلیل مستقیم اسید نوکلئیک استخراج شده از ریزوسفر و کوروسفر در مراحل مختلف رشد و از مکان‌های جغرافیایی مختلف مورد مطالعه قرار گرفته‌اند.

Saffron associated microbiome has been studied by both cultivation-dependent, i.e. culturomic, and cultivation-independent, i.e. metabarcodic approaches. The microbiome has been mainly studied from the root to corm, but few reports are related to the microbiome associated with leaves, stamen, petal, stigma, etc. Researchers have primarily studied diversity and simultaneously tried to isolate Plant Growth Promoting Microbes associated with saffron by culturomics technique. Culturomics has also been used to isolate and characterize the endophytes and the pathogens of saffron. The metabarcodic study on saffron has been initiated and majorly done in our laboratory, with only one report from china. Bacteriome and mycobiome of below ground parts of saffron have been studied by directly analyzing the nucleic acid extracted from the rhizosphere and cormosphere during different growth stages and from different geographical locations.