تحلیل تنوع میکروارگانیسم‌ها در خاک ریزوسفر و پیازهای زعفران چانگمینگ

به منظور مطالعه تنوع میکروبی در خاک ریزوسفری و پیاز زعفران در چنگ‌مینگ، ترکیب جامعه میکروبی با استفاده از فناوری توالی‌یابی با توان بالا Illumina MiSeq تحلیل شد. نتایج نشان داد که باکتری‌ها و قارچ‌ها در سطح شاخه در خاک ریزوسفری و پیازهای زعفران مشابه هستند، اما فراوانی و تنوع میکروبی در خاک ریزوسفری به‌طور قابل توجهی بیشتر از پیازها بود.

با این حال، تنوع میکروبی خاک ریزوسفری در سطوح جنس و گونه به‌طور قابل توجهی بیشتر از پیازها بود. در سطح گونه، خاک ریزوسفری یا پیاز دارای باکتری‌ها یا قارچ‌های منحصربه‌فرد خود است و فراوانی نسبتاً بالایی دارد. همچنین قارچ‌های پاتوژن اندوفیت فیلوفورا و کادوفورا در پیازهای زعفران چنگ‌مینگ شناسایی شدند.

بنابراین، پیش‌بینی می‌شود که بیماری زعفران همچنین به‌طور نزدیک با باکتری‌ها و قارچ‌های اندوفیت آن علاوه بر فلورای خاک مرتبط باشد.این مطالعه به طور موقت ساختار اجتماعی و تنوع میکروارگانیسم‌ها در خاک ریزوسفری و پیازها را توضیح داده و مبنای نظری برای غربالگری بیشتر عوامل استریل مناسب برای خاک و پیاز زعفران چنگ‌مینگ فراهم کرده است.

In order to study the microbial diversity in the rhizosphere soil and bulb of saffron in Chongming, the microbial community composition was analyzed using Illumina MiSeq high-throughput sequencing technology. The results showed that the bacteria and fungi were similar at the phylum level in the rhizosphere soil and saffron bulbs, but the microbial abundance and diversity in rhizosphere soil was significantly higher than that in the bulbs.

However, the microbial diversity of rhizosphere soil was significantly higher than that of bulbs at genus and species levels. At the species level, the rhizosphere soil or bulb has its own unique bacteria or fungi, and has a relatively high abundance. The pathogenic endophytic fungi Phialophora and Cadophora were also detected in Chongming saffron bulbs.

Therefore, it is speculated that saffron disease is also closely related to its endophytic bacteria and fungi in addition to the soil flora. This study has tentatively elaborated community structure and diversity of microorganisms in rhizosphere soil and bulbs, and provided theoretical basis for further screening suitable sterilization agent for Chongming saffron cultivation soil and bulbs