بینش‌هایی از تجزیه و تحلیل پیش‌نویس توالی ژنوم زعفران (Crocus sativus L.)

زعفران (Crocus sativus L.) گیاهی کم‌محصول با اهمیت دارویی و اقتصادی است. بنابراین، گزارش پیش‌نویس توالی ژنوم C. sativus جالب توجه است. پیش‌نویس ژنوم C. sativus با استفاده از توالی‌یابی Illumina جمع‌آوری شده و 3.01 گیگابایت طول دارد که 84.24٪ از ژنوم را پوشش می‌دهد. حاشیه‌نویسی ژنوم C. sativus، 53546 ژن عملکردی (شامل 5726 فاکتور رونویسی)، 862275 تکرار و 964231 نشانگر SSR را شناسایی کرد. ژن‌های دخیل در مسیر بیوسنتز آپوکاروتنوئیدها (کروسین، کروستین، پیکروکروسین و سافرانال) در تجزیه و تحلیل پیش‌نویس ژنوم یافت شدند.

Saffron (Crocus sativus L.) is the low yielding plant of medicinal and economic importance. Therefore, it is of interest to report the draft genome sequence of C. sativus. The draft genome of C. sativus has been assembled using Illumina sequencing and is 3.01 Gb long covering 84.24% of genome. C. sativus genome annotation identified 53,546 functional genes (including 5726 transcription factors), 862,275 repeats and 964,231 SSR markers. The genes involved in the apocarotenoids biosynthesis pathway (crocin, crocetin, picrocrocin, and safranal) were found in the draft genome analysis.