جداسازی ژن‌های اصلی دخیل در گلدهی زعفران به منظور مطالعه پروتئین مؤثر گلدهی

زعفران (Crocus sativus L.) همیشه به دلیل استفاده از گل‌های آن در صنایع غذایی، صنایع رنگ‌سازی و به دلیل ترکیبات سلامتی موجود در گل‌ها و به ویژه کلاله‌های آن کشت می‌شود. با توجه به گران بودن گل‌های آن، بررسی و شناسایی ژن‌های مؤثر بر گلدهی بسیار مهم است و نتایج آن می‌تواند در کنترل نرخ و زمان گلدهی در مراحل اولیه به ما کمک کند. ژن و وضعیت ژنی به نام Pistillata like MADS box (PIC2) برای شناسایی مکانیسم مولکولی آن بررسی شد. توالی مولکولی در این ژن شباهت بالایی به اعضای خانواده MADS دارد که عاملی برای کنترل پروتئین در مرحله گلدهی است. ژن PIC2 با استفاده از منابع بیوانفورماتیک مورد مطالعه قرار گرفت. پرایمرهایی برای تکثیر این ژن طراحی شدند و DNA و RNA از برگ‌های زعفران استخراج گردید. cDNA ژن با استفاده از آنزیم نسخه برداری معکوس ساخته شد و به عنوان الگویی برای تکثیر ژن PIC2 در واکنش زنجیره‌ای پلیمراز (PCR) استفاده شد. قطعاتی به اندازه تقریباً ۹۰۰ جفت‌باز cDNA و قطعه‌ای به اندازه ۲۱۰۰ جفت‌باز DNA تکثیر شدند. این ژن پروتئینی را کد می‌کند که از ۲۱۰ اسید آمینه تشکیل شده و دارای جعبه توالی MADS است. تجزیه و تحلیل ساختار مولکولی پروتئین و مدل‌سازی هم‌سانی (Homological modeling) پروتئین نشان داد که این پروتئین دارای ساختار منظمی است.

Saffron (Crocus sativus L.) always is grown for using its flowers in nutrient industry, color industry and healthy compounds due to its flowers and specially stigmas. Because of its expensive flowers, surveying and recognizing on effective genes for flowering is very important and its results can help us to control rate and timing of flowering at an early stage of flowering. The gene and gene state meant Pistillata like MADS box (PIC2) were surveyed for recognizing its molecular mechanism. The molecular sequence at the genes has high similarity to members of family MADS that is a factor for controls of protein at flowering stage. PIC2 gene was studied by bioinformatics resources. Primers were designed for replicating the gene and DNA and RNA were extracted from saffron’s leaves. The gene’s cDNA was built by recopying enzyme and used such a pattern for replicating gene PIC2 at polymerase chain reactions (PCR). Segments were replicated such 900 cDNA pair-nucleotides and a segment such 2,100 of DNA’s pair-nucleotides. The gene codes a protein that was composed of 210 amino acids that has MADS sequence box. Analysis of protein’s molecular structure and homological modeling of the protein indicated that it has a regular structure.