فیلوژنی گروه گونه‌های زعفران، سری Crocus سرده Crocus (Iridaceae)

روابط فیلوژنتیکی بین آرایه‌های سری Crocus از سرده Crocus هنوز نامشخص است که این امر مانع درک تنوع گونه‌ای و تکامل ادویه مهم زعفران (Crocus sativus) شده است. بنابراین، ما توالی‌های دو ناحیه نشانگر کلروپلاستی (trnL-trnF, matK-trnK) و سه ناحیه نشانگر هسته‌ای (TOPO6، ETS و ITS DNA ریبوزومی) را برای استنباط روابط فیلوژنتیکی بین تمام گونه‌های متعلق به سری Crocus تجزیه و تحلیل کردیم. تحلیل‌های فیلوژنتیکی ما روابط بین تمام آرایه‌های این سری را حل کرد. Crocus hadriaticus و زیرگونه‌های سابق C. pallasii چندتباری ظاهر شدند. مورد اخیر سزاوار ارتقای زیرگونه‌ها به رتبه گونه هستند، در حالی که برای C. hadriaticus مطالعه دقیق مرزهای گونه ضروری است. داده‌های چندکانونی و همچنین چندشکلی تک‌نوکلئوتیدی در سطح ژنوم که از طریق توالی‌یابی ژنوتیپی به دست آمد، C. sativus را درون C. cartwrightianus قرار داد بدون هیچ نشانه‌ای مبنی بر اینکه گونه‌های دیگر Crocus در تکامل تریپلوید مشارکت داشته‌اند. بنابراین، تحلیل‌های ما یک منشأ اتوتریپلویدی برای C. sativus از C. cartwrightianus را بسیار محتمل می‌سازد.

Phylogenetic relationships among the taxa of Crocus series Crocus are still unclear, preventing the understanding of species diversity and the evolution of the important spice saffron (Crocus sativus). Therefore, we analyzed sequences of two chloroplast (trnL-trnF, matK-trnK) and three nuclear (TOPO6, ribosomal DNA ETS and ITS) marker regions to infer phylogenetic relationships among all species belonging to series Crocus. Our phylogenetic analyses resolved the relationships among all taxa of the series. Crocus hadriaticus and the former C. pallasii subspecies appeared polyphyletic. The latter deserve elevating the subspecies to species rank, while for C. hadriaticus a detailed study of species boundaries is necessary. Multi-locus and also genome-wide single nucleotide polymorphism data obtained through genotyping-by-sequencing placed C. sativus within C. cartwrightianus with no indication that other Crocus species contributed to the evolution of the triploid. Our analyses thus made an autotriploid origin of C. sativus from C. cartwrightianus very likely.