بررسی رابطه بین نشانگرهای SSR و صفات زراعی در زعفران

هدف: این آزمایش با هدف یافتن رابطه بین صفات مورفولوژیکی، فیزیولوژیکی، متابولیت‌ها با نشانگرهای SSR انجام شد.

روش پژوهش: برای بررسی رابطه بین صفات کمی و نشانگرهای SSR (تکرارهای ساده توالی)، آزمایشی در شرایط مزرعه و آزمایشگاهی در دانشگاه زنجان انجام شد. در این آزمایش از 20 پرایمر SSR استفاده شد و صفات زراعی و فیزیولوژیکی همراه با متابولیت‌های ثانویه در طول فصل رشد اندازه‌گیری شدند.

یافته‌ها: پرایمرهای تقویت‌شده مجموعاً 38 باند تولید کردند و میانگین تعداد باندها در تمام لوکوس‌ها 2.38 باند بود. بیشترین تعداد الل‌ها (5 الل) و محتوای اطلاعات پلی‌مورفیک (0.9) مربوط به پرایمر A2 بود. نتایج تحلیل رگرسیون مرحله‌ای نشان داد که پرایمرهای مورد بررسی (10 پرایمر) با اکثر صفات رابطه معنی‌دار دارند و بالاترین R2 در سال اول شامل شاخص برداشت (79%)، وزن خشک خامه (69%)، وزن تازه گل (62%) و عملکرد (62%) بود.در سال دوم، شاخص برداشت (۶۷٪)، تعداد برگ‌ها (۶۵٪)، تعداد گل‌ها (۶۱٪) و محصول (۶۴٪) بالاترین ضریب تعیین را داشتند. پرایمرهای C25 و C50 به ترتیب با ۵ و ۴ صفت کمی در سال ۲۰۱۴ و ۴ و ۳ صفت کمی در سال ۲۰۱۵ مرتبط بودند. پرایمرهای C25 و C50 به ترتیب ۲ و ۳ آلل در جمعیت مورد مطالعه شناسایی کردند و با توجه به تعداد لوکوس‌های شناسایی‌شده، می‌توان آن‌ها را پرایمرهای مهم در ارتباط با صفات کمی در نظر گرفت. پرایمرهای A8، A10، A48 و A2 در طول دو سال آزمایش با حداقل بیش از ۴ صفت مرتبط بودند. با توجه به رابطه مشاهده‌شده، می‌توان از این لوکوس‌های مارکری برای انتخاب اکوتیپ‌های مورد نظر با کمک نشانگر در جمعیت‌های زعفران استفاده کرد.

محدودیت‌ها: هیچ محدودیتی برای گزارش وجود ندارد.

اصالت/ارزش: پرایمرهای C50، C25، A8، A2 و C36 به عنوان نشانگرهای کاندیدا در برنامه‌های بهبود زعفران با کمک نشانگر محسوب می‌شوند.

“Purpose: This experiment aimed find the relationship between morphological, physiological traits, metabolites, with SSR markers.

Research method: To investigate the relationship between quantitative traits and SSR (Simple sequence repeat) markers, an experiment was conducted under both field and laboratory conditions at Zanjan University. In this experiment, 20 SSR primers were used and agronomic and physiological traits with secondary metabolites were measured during the growing season.

Findings:
Amplified primers generated a total of 38 bands and the average number of bands in all locus was 2.38 bands. The highest number of
alleles (5 alleles) and the polymorphic information content (0.9) were for the A2 primer. The stepwise regression analysis results showed that the studied primers (10 primers) had a significant relationship with most traits and the highest R2 in the first year was  harvest index (79%), dry weight of stigma (69%), fresh weight of flower (62%), and yield (62%). In the second year, harvest index  (67%), number of leaves (65%), number of flowers (61%), and yield  (64%) had the highest coefficient of determination. The C25 and C50 primers were associated with 5 and 4 quantitative traits in 2014 and 4 and 3 quantitative traits in 2015, respectively. The C25 and C50 primers identified 2 and 3 alleles in the study population respectively, and considering the number of identified loci, it can be considered as the important primers concerning quantitative traits. The A8, A10, A48 and A2 primers were associated with at least more than 4 traits during the two years of experiment. According to the observed relationship, these marker loci can be used to select ecotypes with marker-assisted in saffron populations.

Limitations:
No limitations to report.

Originality/Value: C50, C25, A8, A2, and C36 primers are candidate markers in marker-assisted selection
saffron breeding programs. “