گونه‌های جدید اندوفیت Talaromyces بخش Talaromyces مرتبط با گیاه زعفران برای مایکوبیوتای ایران

زعفران (Crocus sativus L.) گران‌ترین و باارزش‌ترین ادویه در جهان است. کلاله‌های زعفران منبع ارزشمندی از آپوکاروتنوئیدها مانند کروcin، پیکروکروcin و سافرانال هستند. مطالعات ترانسکریپتوم و بیان ژن‌ها مراحل مهمی در بررسی متابولیت‌های ثانویه در گیاهان هستند. یکی از پیش‌نیازهای مهم برای چنین مطالعاتی، شناسایی ژن‌های مرجع قابل اعتماد و پایدار برای نرمال‌سازی بیان سایر ژن‌هاست. در مطالعه حاضر، هشت ژن مرجع با استفاده از ترانسکریپتوم زعفران شناسایی و جداسازی شدند و پایداری بیان آنها با استفاده از روش‌های آماری غیرپارامتری ارزیابی شد.

نتایج تقویت و توالی‌یابی شناسایی دقیق هشت ژن مرجع اکتین، EF1، GAPDH، H3، MDH، TBP، UBC و UBQ را نشان داد. ارزیابی پایداری بیان نشان داد که ژن‌های MDH و UBQ بالاترین پایداری را در بین بافت‌های مختلف زعفران داشتند و TBP کمترین پایداری را در میان آنها داشت.در این مطالعه، هشت ژن مرجع جدا شده و پایداری بیان آن‌ها از انواع بافت‌های زعفران برای اولین بار ارزیابی شد. ژن‌های مرجع شناسایی‌شده در این مطالعه می‌توانند به عنوان ژن‌های پایدار برای نرمال‌سازی بیان ژن در مطالعات ترنسکریپتومی و بیان گیاه زعفران استفاده شوند.

“Saffron (Crocus sativus L.) is the most valuable and expensive spice in the world. The stigmas of saffron are the source of valuable apocarotenoids such as crocin, picrocrocin, and safranal. Transcriptomic and expression studies of genes are important steps in investigating of secondary metabolites in plants. One of the important prerequisites for such studies is identification of reliable and stable reference genes to normalize the expression of other genes. In the present study, eight reference genes were identified and isolated using transcriptome of saffron and their expression stability was evaluated by non-parametric statistic methods.

The results of amplification and sequencing showed accurate identification of eight reference genes Actin, EF1, GAPDH, H3, MDH, TBP, UBC, and UBQ. The expression stability evaluation revealed that MDH and UBQ genes had the highest stability among different saffron tissues and TBP had the lowest stability among them. In this study, eight reference genes were isolated and their expression stability was evaluated from different tissue types of saffron, for the first time. The reference genes identified in the present study can be used as stable genes to normalize gene expression in transcriptomic and expression studies of saffron plant.”