رديابي سرلوژيکي و مولکولي ويروس پژمردگي لکه اي گوجه فرنگي در برخي علف هاي هرز در مزارع زعفران

زعفران یکی از مهم‌ترین محصولات کشاورزی و صادراتی در ایران است و شناسایی عوامل کاهش‌دهنده آن اهمیت دارد. ویروس پژمردگی لکه‌دار گوجه‌فرنگی یکی از ویروس‌های مخرب است. علف‌های هرز گیاهان مخزن ویروس‌ها هستند. به منظور شناسایی و تشخیص TSWV در گیاهان مخزن، ۳۷ نمونه علف هرز از خراسان جنوبی شامل بیرجند، سرایان، فردوس و قاین در ماه‌های آوریل و مه ۲۰۱۷ جمع‌آوری شد و با روش DAS-ELISA آزمایش گردید. نمونه‌های مثبت در ELISA با روش RT-PCR و پرایمرهای مخصوص ژن نوکلئو پروتئین (N) مورد آزمایش قرار گرفتند و قطعاتی به طول ۷۷۷ جفت باز تکثیر و توسط شرکت Macrogene توالی‌یابی شدند. نتایج نشان داد که Cadaria draba و Hordeum murinum به TSWV آلوده هستند. در تحلیل فیلوژنتیک با دو ایزوله و ۲۰ ایزوله بانک ژن، دو گروه تشکیل شد. دو ایزوله این مطالعه در گروه II و زیرگروه A قرار گرفتند.نزدیک‌ترین نمونه ژن‌بانک از مونته‌نگرو (GU339506) با ۹۷/۳٪ در چنپوودیوم کینوا بود و دورترین نمونه از ایتالیا (GU36971) روی نیکوتیانا تباروم به دست آمد. این تحقیق نخستین بررسی علف‌های هرز به عنوان میزبان وحشی ویروس TSWV در مزارع زعفران خراسان جنوبی است.

Saffron is one of the most important crop in agriculture and export of Iran and identification of the reduced agents is important. Tomato spotted wilt virus (SWV) is one of the destructive viruses. Weeds are reservoir plants of viruses. In order to detect and identify the TSWV on reservoir plants, 37 weed samples were collected from South Khorasan, including Birjand, Sarayan, Ferdows and Ghaen during May and April 2017 and were tested by DAS-ELISA. The positive samples in ELISA were tested by RT-PCRand specific primers of Nucleoprotein (N) gene were amplified a fragments with 777 bp length and sequenced by Macrogene company. The results showed thatCardaria draba and Hordeum murinumwere infected by TSWV. In Phylogenetic analysis with two isolates and 20 isolates of gene bank two groups were formed. Two isolates of this study, felt in Group II and subgroup A. The closest gene bank isolate was from Montenegro (GU339506) with 97.3% on Chenopodium Quinoa and the furthest isolate was from Italy (GU36971) on Nicotiana tabacum. This research was the first survey of weeds as a natural host of TSWV in saffron fields of South Khorasan.